Karşıyaka, Küçük Yamanlar Tepesi üzerinde ve su deposu kazısı sırasında tahrip olan höyükte bulunan kültür tabakaları ile etrafa saçılan seramik buluntularından yola çıkılarak yapılan tarihlendirmeyle Eski İzmir’den daha eski bir tarihsel geçmişe sahiptir. Tepede görülen en erken tarihli seramikler uzmanlar tarafından Neolitik Çağ’ın geç safhasına (İ.Ö. 5000) tarihlendirilmektedir.

Karşıyaka’nın gelişimi 1865 yılında tren yolunun yapılması ile başlar, 1884 yılında kurulan “Hamidiye Vapur Şirketi”nin Karşıyaka’daki ahşap iskeleye vapur seferleri düzenlemesi ile hızlanır. Demiryolu hattının toprak altına alınarak Metro için kullanılması ile işlevini yitiren İstasyon Binası ve müştemilatları restorasyon uygulaması sonrasında müze, sergi salonu, hediyelik satış, kafe, restoran, çay bahçesi olarak kullanılacaktır.